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AMBER講習会
Amberは分子力学・動力学計算シミュレーションプログラムのパッケージです。
溶媒水分子の配置や電荷のフィッティングを行なうビルダーモジュールなどのプログラムが多数用意されています。
| 対象 | 一般向け、在学生・教職員向け、その他 |
|---|---|
| 開催日時 | 2026.05.25 (月) 13:00 ～ 2026.05.25 (月) 17:00 |
| 開催場所 | 伊都キャンパス |
| 会場名 | 九州大学 情報基盤研究開発センター 2階 セミナー室（210） |
| 会場の住所 | 〒819-0395 福岡市西区元岡744 |
| 定員 | 先着 10名 |
| 参加費 | 無料 |
| イベント詳細 | ※実習あり ・Jupyter notebookの説明 ・トポロジーおよび座標ファイルの作成 - タンパク質の力場の読み込み - アラニン・ジペプチド系の構築 - Amberのprmtopとinpcrd入力ファイルの保存 ・分子動力学計算の実行 - 構造最適化の設定入力および実行 - 昇温の設定入力および実行 - プロダクション行程の入力および実行 ・ログの解析 ・動力学計算の結果の解析 - トラジェクトリーのRMSD解析 ・Amberパラメーターの詳細 - 一般有機分子パラメーターの調製 - PDB形式ファイルの入手およびAmber用に修正 - たんぱく質と有機分子を含む系の構築 ・シミュレーションの実行 |
| 申込方法 |
事前申し込みの必要あり [Webサイト] ※以下URLよりお申し込みください。 https://forms.cloud.microsoft/r/jCAXwt3mrG ※入力された個人情報は講習会開催にかかる事務処理にのみ利用します。 |
| 申込受付期間 |
2026.04.17 (金) - 2026.05.18 (月) |
| お問合せ先 |
担当：情報基盤課 研究支援担当 |
| ホームページ | |
| 公開期間 | 2026.04.21 (火) - |
| 関連データ |