多発性硬化症の遺伝的背景を多様な人種集団とオミクスから解明

• 日本人集団としては初となる大規模な多発性硬化症（注1）のゲノムワイド関連解析（GWAS：注2）を実施し、計688名の患者と205,199名の対照者を解析して、これまで報告のなかった日本人集団特異的なリスク領域を同定しました。
• 国内外のバイオバンク（注3）のデータを活用し、日本（東アジア）・ヨーロッパ・アフリカ・アメリカ大陸系の4人種集団、計29,374名の患者と1,843,563名の対照者を統合したGWASメタ解析（注4）により、新規の疾患感受性領域を計22か所同定しました。
• GWASの結果をシングルセル解析（注5）と統合することで、従来注目されていた免疫細胞に加え、血管内皮細胞にも遺伝的リスクが集積することが示されました。
• GWASの結果を空間トランスクリプトーム解析（注6）と統合することで、多発性硬化症の脳病変内では血管周囲の免疫細胞浸潤領域や病変辺縁部など、持続的な活動性の高い領域で、遺伝的リスクが強く集積することを明らかにしました。

　東京大学大学院医学系研究科遺伝情報学の藤本凜太郎大学院生（博士課程、兼：理化学研究所生命医科学研究センター システム遺伝学チーム 研修生）、岡田随象教授（兼：理化学研究所生命医科学研究センター システム遺伝学チーム チームディレクター、大阪大学免疫学フロンティア研究センター（IFReC） 免疫統計学 招へい教授、同ヒューマン・メタバース疾患研究拠点（PRIMe） 招へい教授）、大阪大学大学院医学系研究科神経内科学の小河浩太郎助教、奥野龍禎准教授、九州大学大学院医学研究院神経内科学の磯部紀子教授らによる研究グループは、日本多発性硬化症/視神経脊髄炎スペクトラム障害バイオバンク（Japan MS/NMOSD Biobank：注7）、バイオバンク・ジャパン（注8）、UKバイオバンクをはじめとする国内外のゲノムデータを用いて、多発性硬化症の遺伝的背景を多様な人類集団にわたって解析しました。
　その結果、日本人集団の解析からは、これまでどの集団でも報告されていなかった11q24の新規リスク領域が同定されました。この領域の近傍には、リンパ球系細胞の分化に必須の転写因子をコードし、血液脳関門（注9）の維持にも関与するETS1遺伝子が位置しています。さらに4つの人種集団を統合したGWASメタ解析により、計22か所の新規疾患感受性領域を同定しました。加えて、日本人集団における主要組織適合性複合体（MHC：注10）領域の詳細な解析により、クラスII ヒト白血球抗原（HLA：注11）遺伝子に4つの独立した関連を同定しました。
　また研究グループは、多発性硬化症患者の末梢血単核球のシングルセル遺伝子発現データをGWASの結果と統合しました。その結果、従来注目されてきた免疫細胞に加えて、血管内皮細胞にも遺伝的リスクが集積することが示されました。さらに、脳病変の空間トランスクリプトームデータとの統合解析により、遺伝的リスクが病変内の特定の部位に偏って集積し、その分布が病変の活動性によって異なることを明らかにしました。
　本研究は、多発性硬化症の疾患感受性の理解を多様な人種集団へと広げるとともに、疾患の遺伝的背景を「どの細胞で」「組織のどの場所で」という細胞・空間レベルの解像度でとらえる新たな研究の枠組みを示すものです。
　本研究は2026年9月7日（現地時間）に国際科学誌Nature Geneticsに掲載されました。

（注1）多発性硬化症
　自己免疫の異常により免疫細胞が脳や脊髄の細胞を攻撃する慢性疾患。

（注2）ゲノムワイド関連解析（GWAS）
　遺伝的変異と疾患の発症リスクの関連をゲノム全体で網羅的に調べる遺伝統計学的解析手法。

（注3）バイオバンク
　個人から提供された生体試料や臨床情報を保管し、医学研究に役立てる仕組み。

（注4）GWASメタ解析
　異なるの研究や人種集団から得られたGWASの結果をメタ解析する手法。解析に含められるサンプルや遺伝的変異の数が増えることで、疾患に関連するゲノム領域をより多く見つけることができる。

（注5）シングルセル解析
　一細胞ごとに遺伝子発現を解析する手法。組織単位の解析では困難な、細胞種ごとの高解像度な情報を得ることができる。

（注6）空間トランスクリプトーム解析
　組織内での位置情報を保ったまま遺伝子発現を解析する手法。従来のシングルセル解析では失われていた細胞の位置や細胞同士の相互作用を捉えることができる。

（注7）日本多発性硬化症/視神経脊髄炎スペクトラム障害バイオバンク（Japan MS/NMOSD Biobank）
　九州大学などが全国の脳神経内科専門施設と協働し、多発性硬化症およびその類縁疾患である視神経脊髄炎スペクトラム障害の研究を進めるために構築したバイオバンク。

（注8）バイオバンク・ジャパン
　東京大学医科学研究所を中心に運営されている日本最大級のバイオバンク。

（注9）血液脳関門
　血液から脳に病原体や異物が侵入しないようにする構造。多発性硬化症では、血液脳関門に障害が起こることで免疫細胞が脳に浸潤しやすくなっていると考えられている。

（注10）主要組織適合性遺伝子複合体（MHC）
　自己と非自己を見分けるために細胞表面に存在するタンパク質。

（注11）ヒト白血球抗原（HLA）
　ヒトにおけるMHC分子の呼び名。個人差が大きく、自己免疫疾患や感染症の発症に関連することが知られる。

雑誌名：Nature Genetics
題　名：Multiancestry genome-wide association and multiomics analyses elucidate spatiocellular features of multiple sclerosis genetics
著者名：Rintaro Fujimoto#, Kotaro Ogawa#, Shinichi Namba, Yosuke Ogawa, Ryuya Edahiro, Kyuto Sonehara, Shiori Tagawa, Mitsuru Watanabe, Tomohiro Yata, Yuya Shirai, Yuji Yamamoto, Go Sato, Chifune Kai, Tatsuhiko Naito, Akiko Hosokawa, Mamoru Yamamoto, Japan MS/NMOSD Biobank, the BioBank Japan Project, Koichi Matsuda, Fumitaka Shimizu, Makoto Kinoshita, Masahito Mihara, Masayuki Nakamori, Yuko Shimizu, Izumi Kawachi, Katsuichi Miyamoto, Masaaki Niino, Atsushi Kumanogoh, Yuji Nakatsuji, Takuya Matsushita, Hideki Mochizuki, Jun-ichi Kira, Tatsusada Okuno✝, Noriko Isobe✝ and Yukinori Okada✝
#同等貢献、✝責任著者

DOI: 10.1038/s41588-026-02741-5

• 本件の詳細はこちら

医学研究院　磯部紀子　教授